凈化工程是在一定空間范圍內，將空氣中的微粒子、有害空氣、細菌等污染物排除，并將室內溫度、潔凈度、壓力、氣流速度與氣流分布、噪音振動及照明、靜電控制在某一需求范圍內的工程學科。凈化工程所特別設計的房間，不論外在空氣條件如何變化，室內均具有維持原先所設定要求之潔凈度、溫濕度及壓力等性能。GMP車間凈化工程凈化原理氣流→初效凈化→空調→中效凈化→風機送風→管道→高效凈化風口→吹入房間→帶走塵埃細菌等顆粒→回風百葉窗→初效凈化重復以上過程，即可達到凈化目的。
GMP車間凈化工程對于亂流式潔凈室減少室內污染主要是通過空氣的稀釋作用來完成的，因此，一般不用速度而是用換氣數來說的。但是，對潔凈室潔凈工程中的氣流速度也是有要求，和單純空調房間相比，送風口的出口處氣流不要太大。吹過水平面的氣流速度不宜太大，以免吹起表面微粒重返氣流，而造成再污染，這一速度一般不宜大干0.2m/s。潔凈工程中凈化效果的如何，要看每步流程是否達標，只有全方面考慮到，才能達到預期的效果。