竣工驗收的調試工作要分以下四個步驟進行。①調試前的準備工作。②單機試車。③聯動調試。④潔凈室的性能測試和綜合評價。
（一）調試前的準備工作
1、調試的組織準備：
成立以建設單位（業主）為組長的有設計單位、施工單位、監理單位人員參加的調試小組。調試小組領導調試的全面工作，調試小組協調各方面的關系，調試小組為調試工作提供各種軟硬條件。
2、編制調試大綱
在調試小組領導和組織下，編制調試大綱。調試大綱是調試工作的指導性文件。調試大綱的內容包括：組織分工、人員安排、物資調動；調試項目、調試方法、調試儀表；調試程序、調試進度、調試計劃安排等。調試大綱的編制使調試人員思想明確、認識統一、步調一致、行動整齊，使調試工作順利進行。
3、施工現場質量的會檢。
在調試小組的領導組織下，有建設單位、設計單位、施工單位、監理單位的有關領導和技術人員參加，對施工現場、施工質量進行全面會檢。從冷凍站、換熱站、鍋爐房、變配電站、空調機房到供冷、供熱、供電系統、空調凈化系統和自動控制系統。從設備（冷凍機、鍋爐、水泵、冷卻塔、空調器等）、配件（閥門、風口、消聲器等）、管道和管線到保溫、設備基礎、管道支吊架等的工程施工質量進行全面會檢。看是否按圖施工、查與設計圖不符之處，找施工質量不合格項目并查其原因。并對施工、加工、安裝等質量問題逐一填寫“缺陷明細表”，提出整改意見，限期（正式調試之前）整改完畢。
4、空調設備、空調系統的清掃：
①調試之前對潔凈室進行全面、徹底的清掃是十分必要的。對潔凈室的地面、墻面、吊頂、門窗進行認真、全面、徹底的大掃除（最好請專業的清潔公司）；對空調設備、空調管道（送風管、回風管、新風管），空調配件（清聲器、閥門、風口等）進行檢查、檢漏和擦試。達到潔凈要求為止。
②安裝粗效、中效過濾器進行第一次空吹。在徹底清掃的基礎上，安裝空調器內的粗效和中效過濾器。對整個凈化空調系統進行空吹，空吹時間為24~36小時，使整個系統得到初步的凈化。
③安裝高效過濾器。系統空吹后可以安裝高效過濾器。高效過濾器在安裝之前，要求對其逐一進行檢漏，對有泄漏者進行堵漏。檢漏在臨時檢漏臺上進行，塵源利用大氣塵。被檢合格的高效過濾器方能進行安裝，安裝完畢后對高效過濾器的安裝密封再進行檢漏（利用塵埃粒子計數器掃描），達到安裝合格。
④高效過濾器安裝檢漏合格后再對凈化空調系統進行第二次空吹。空吹時間24小時，然后方可進行入調試程序。
5、測試儀器、儀表、工具的準備
①調試前要對調試中所用的儀器儀表進行調試和標定（超過使用時間還需重新進行標定）。所用的儀表包括測量風速、風量、溫度、相對濕度、壓差、噪聲、振動、轉數、時間、大氣壓力和潔凈度的儀器儀表等。
②調試所用的器材、工具的準備。如：電工工具、管工工具、扳金工工具、鉗工工具以及爬高上下的梯子等。并且請施工單位配合電工、管工、扳金工和鉗工。
③調試和測試工作所用的圖紙和記錄表格的準備。
（二）單機試車
單機試車是對工程中的所有的設備、配件等單體進行試車。單機試車的目的是對這些設備、配件的安裝質量和產品出廠質量的檢查和考核。單機試車的主要內容有：
水、電先行。即首先對供水供電的設備和系統進行檢查和考核。如水泵、變壓器、配電箱、開關等。要保證供水、供電的正常、可靠。
進而，對供冷設備（冷凍機、冷卻塔、冷凍水泵、冷卻水等）、供熱設備（鍋爐、換熱器、熱水泵等）、空調設備（表面冷卻器、加熱器、加濕器、過濾器、風機等）、自動控制設備、儀表、閥門以及各系統的配件進行單體考核。看是否能滿足設計要求和正常運行。尤其對轉動設備如風機、水泵要試轉看是否運轉平穩，有無雜音和碰撞和反轉現象；用電設備接線是否正確；冷凍機和鍋爐是否能達到設計要求；空調器中表冷器的降溫去濕能力、加濕器的加濕能力等等進行單體檢查、考核。如果出現故障和發現問題，應立即排除。
對于大型設備如冷凍機、鍋爐、空調器等（尤其是進口設備）在單機試車時最好有生產廠家的調試人員現場指導或由生產廠家負責試車，待運轉正常后再移交給使用單位。單機試車為聯動調試做好各個單體設備的準備工作。
（三）聯動調試
聯動調試一般情況下分為兩個階段進行，即風量分配階段和聯動調試階段。
1、風量分配：
風量分配即將各個潔凈室的送風量、回風量、新風量、排風量全部按設計要求調整到設計風量。因為一個潔凈廠房可能有多個空調送風系統和排風系統，或一個空調送風系統要負擔多個潔凈室的送風。因此，風量分配調試工作是一項工作量大、時間長、耐心細致的工作。風量分配調試工作也是整個調試工作的重點工作。常用的風量分配調試方法采用標準風口法。
標準風口法：一個潔凈室可能有幾個、幾十個空調送風口、回風口。因為它們之間都是相通的，當調整某一個風口送風的風量時其他送風口的風量也會跟其變化。因此，采用標準風口法。
所謂標準風口法，就是在風量分配之前，將所有閥門都開到最大的情況下，在所有的送風口這中找到最不利的送風口（送風量最小的送風口），將此風口作為標準風口。在標準風口上設一監測儀表，隨時測試標準風口的風量變化。然后調整其它所有風口風量。因為調整任何一個風口風量時，都會影響已調整過的風口的風量的變化；因此，在調整任何一個風口風量時，都要以標準風口當時風量為參照風量，使所有被調風口的風量均隨標準風口的風量變化而同步變化。
當一個凈化空調系統負責多個潔凈室空調時，調試要以潔凈室為單位由末端向總干管方向進行，對各潔凈室首先調整其送風量的相對關系量，然后，再用系統的總閥門來將每個送風口，每個潔凈室的送風量都調整為真實的設計送風量。
2、聯動調試
聯動調試在風量調整和單機試車后進行。聯動調試就將凈化空調系統和為凈化空調系統服務的所有系統即：供冷系統（冷凍機、冷卻塔、水泵以及供冷系統上所有的配件）、供熱系統（鍋爐、水泵以及供熱系統上所有配件）、供電系統（配電箱、變頻器……）和自動控制系統全部投入運行，考核各系統的綜合性能和聯動性能。必要時，在潔凈室內人為的設置一定量的負荷，考核溫、濕度探頭、中間儀表和執行機構的聯動是否敏感、協調；考核溫、濕度探頭是否準確，精度是否合格。
（四）潔凈室的性能測試和綜合評價
在風量調整和聯動調試的基礎上，潔凈室空調凈化系統以及為其服務的所有系統，均處于正常運行狀態。接著進行潔凈室的性能測試和綜合評價。
1、潔凈室的性能測試：
潔凈室性能測試內容包括：
潔凈度測試、風量測試、正壓測試、風速測試（單向流潔凈室）溫度、相對濕度測試、噪聲測試等。
①潔凈度測試：采樣點布置在工作面上（0.8~1.0m），采樣點數量N=A1/2（A是潔凈室面積‘m2’）。塵埃粒子計數器的采樣量要大于1升/分；每個采樣點連續有效采樣三次。取其平均值做該點的測量值。全部測點的測量值的平均值作為潔凈室的潔凈度。
②風量或風速測試：單向流潔室測量斷面風速、非單向流潔凈室測其風量。
斷面風速的測量：距吊頂上送風高效過濾器（HEPA）300mm處布置測點，測點間距為600mm，用熱球風速儀測其各點風速。
風量測試：在送風管或送風口上測送風風量。方法是用比托管和微壓差計，測風管內各點的動壓，測點間距為100mm。再計算送風量。
③正壓測試：在關門的狀態下，測潔凈室的正壓。采用補償式微壓計測量。
2、潔凈室的綜合評價。
在對潔凈室性能測試的基礎上，根據對潔凈室潔凈度、溫、濕度、正壓、風量、噪聲等測試結果，對潔凈室的建設和性能進行竣工驗收的綜合評價。