1、樣品的轉運和人員流動：分配實驗室區域，首先應考慮工作流程、樣品 的轉運和流轉、生物安全因素等。
2、靈活性：無菌室裝修能否適應未來發展變化的需要是極其重要的。
3、安全性：實驗室的設計和大小應考慮安全性，滿足緊急清除和疏散出口的建筑規則，針對各實驗室情況配備安全設備。距危險化學試劑30米內，應設有緊急洗眼處和淋浴室。所有的實驗室和與污染物直接接觸的地方均應安裝洗手池，將洗手池設在出口處。
4、設立煙霧罩和安全設施：任何安全罩的放置均應盡量遠離出口處，以符合有害實驗遠離主通道的原則。
5、無菌室裝修實驗臺面應防水，耐腐蝕、耐熱。實驗室邊臺墻面和教師講臺各配備兩組多功能插座，實驗操作臺采用帶儲物柜式的，臺面設計藥品架，桌臺設計應考慮方便實驗操作，如桌臺下方略凹能容納坐姿實驗者的雙腿，實驗桌臺每隔1m左右設立兩組多功能插座等。
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