潔凈室是醫藥生產的必須環境，生產環境中的潔凈程度對藥品質量有著至關重要的影響。如果生產環境有污染存在，則藥品質量就不能保證，使用這樣的藥品不僅會對患者的病情有不良的影響，還會造成負面的社會反響。在醫藥領域的凈化工程中，如何去對工程進行污染的控制，以達到相關規定的要求呢？
第一，要提高工作人員的潔凈意識，加強管理。在潔凈室中，最大的污染源是人。對凈化工程中污染源的來源進行統計發現，超過三分之一的微粒污染是由人員流動等人為因素造成的，其次有四分之一是生產過程本身會帶來的污染，可見對人員潔凈的管理至關重要。因此，要加強工作人員的培訓，在進入凈化車間時要遵守規范，提高潔凈意識。
第二，對人流和物流的通道進行嚴格把關。每個凈化車間都有獨立的人流、物流通道。工作人員進入時要一一按照規定進行個人凈化工作，不能馬虎了事，其次，對進入車間工作人員的人數也要嚴格把關。除了對人流的管理，物料進入凈化車間時，也要進行潔凈操作，以此最大地降低對凈化工程的污染。