無菌手術室的清潔度應達到10,000，室內溫度應保持在20°C-24°C，濕度應保持在45％?60％，潔凈工作臺的清潔度應達到100。 每月應在無菌室內檢查菌落數量。 在無菌室或無塵工作臺打開的狀態下，取出許多內徑為90mm的無菌陪替氏培養皿，并且將無菌的融化并冷卻至約45℃的平板計數瓊脂無菌注入。 放置并固化15 mL培養基，然后在36°C±1°C的培養箱中放置48小時。 消毒后，放置3到5個板，放置在工作位置的左右，左右位置，并露出蓋板。 一分鐘后，將其置于36°C±1°C的培養箱中48小時，然后取出進行檢查。 100級潔凈區中的平板細菌平均數量不得超過1個菌落，而10000級潔凈室中的平均潔凈室則不得超過3個菌落。 如果超過限值，則應對無菌室進行徹底消毒，直到再次檢查合格為止。
無菌室應保持整潔。 僅將必需的檢查工具（例如酒精燈，酒精棉，打火機，鑷子，接種環，剪刀和玻璃筆）存放在室內。 嚴禁堆放雜物以防止污染。 無菌室應提供工作濃度的消毒劑，例如5％的甲酚溶液，75％的酒精，0.1％的新螯合劑溶液等。 需要帶入無菌室的儀器，藥品，玻璃器皿等應緊密包裝或通過適當方法進行滅菌。 例如，將培養皿和吸管在干燥箱中在160℃至170℃下滅菌1h至2h，并且將生理鹽水通過高壓釜在121℃下滅菌20分鐘。 在使用無菌室之前，必須將無菌室和緩沖室的紫外線燈打開30分鐘以上，并同時打開凈化風扇進行通風。 紫外線燈關閉后僅半小時即可進入無菌室工作。 檢查樣品后，應及時清潔剩余的樣品以及各種藥物和玻璃器皿，并應打開所有紫外線燈并對其消毒30分鐘。
無菌室通常是在微生物實驗室專門設置的小室。 面積不要太大，大約4m2?5m2，高度大約2.5m。 無菌室外室應設有緩沖室，凈化空氣淋浴室和更衣室。 無菌室和緩沖室都必須密封。 室內設備必須裝有空氣過濾器。 紫外線燈安裝在無菌室和緩沖室中，無菌室中的紫外線是從工作表面發出的。 無菌室的地板和墻壁必須平坦，不易隱藏污垢，且易于清潔。 工作臺的桌面必須水平。 進入無菌室的工人應在更衣室里穿著無菌的衣服，帽子和鞋子，經過潔凈的空氣淋浴，進入緩沖室，然后進入無菌室進行檢查。