在凈化空調循環系統中，未能及時的處理系統氣流中攜帶的活細菌，其主要原因是人們對噬菌體和污染過程了解不足。今天康德萊凈化說說哪些引起凈化空調系統在口罩車間凈化工程中的不足。
（1）人們經常依靠清潔車間的日常清潔和消毒，以及清潔車間和凈化空調系統的定期熏蒸和滅菌，認為通過消毒熏蒸就能夠把活菌殺滅，從而根除污染源。殊不知，即使每天對潔凈室進行清潔消毒或每天進行熏蒸滅菌，那也只能在生產結束后進行，這是靜態過程。可是口罩車間凈化工程中，噬菌體則在生產過程中會隨時對凈化空調系統和生產環境產生污染，這是個動態過程，且污染的速度是相當快的。所以，我們要對引發噬菌體的污染有足夠的重視，要進行動態預防和控制。
（2）也有人認為，噬菌體只能在處于生殖階段的活細胞中繁殖，而不能在死的，老的，休眠的細胞中繁殖。所以，在口罩車間凈化工程凈化的過程中發酵液會出現噬菌體污染，而凍干后的活菌處于休眠狀態，不會被噬菌體污染。
首先，在生物活性細菌制劑的生產中，發酵本身不會產生噬菌體污染。大量生產實踐證明，口罩車間凈化工程過程中發酵液出現噬菌體污染的主要原因不外乎是：
①使用了被噬菌體污染了的菌種；
②生產環境中存在噬菌體，因此與發酵接觸的空氣會攜帶噬菌體。
這兩個原因均歸因于空氣中噬菌體的污染。所以，口罩車間凈化工程中，我們要防止發酵中噬菌體污染，必須防止生產環境的空氣中出現噬菌體。而要防止空氣中出現噬菌體，就必須保證生產環境中沒有噬菌體賴以生存的寄主，即活菌體的存在。
其次，處于休眠狀態的活細菌并不意味著它們已經死亡。細菌由于饑餓，溫度，氧氣和光照等外部壓力而進入休眠狀態。口罩車間凈化工程中，休眠能幫助細菌進入到一種自我保護的機制，進入休眠狀態以后，細菌由于自身代謝速率降低，降低了對營養的要求，提高了存活的可能。當環境變得適宜后，又可以復蘇，這些細菌就又獲得了生機。
一旦活細菌恢復了生物活性，它們將在一定條件下死亡，增殖，退化和變異，從而對生產環境造成二次污染。在口罩車間凈化工程的凈化空調系統中，如果受到外界新風的影響，也依然會產生噬菌體污染。