凈化工程可控制車間內的有害細菌、微塵顆粒等污染物、還可以控制溫濕度、噪音，打造高潔凈度、舒適的生產環境。這不僅保障了產品的生產安全，也為工作人員創造出宜人的工作環境，從而提高工作效率，凈化工程已經成為諸多食品企業提升自身實力的有力法寶。
凈化車間最好能與外界隔離，不能穿行或受其他因素干擾。凈化車間的大小依需要而定，一般由更衣間、緩沖間、風淋室和操作間組成。在實施凈化工程時，一般從建筑平面布置、食品車間結構、車間地面、通風孔器凈化設備、照明等幾個方面來考慮。
1.建筑平面布置。建筑平面設計各凈化操作間集中設置獨立前室為氣閘，實驗室的人流經過更衣室更衣換鞋→清洗間洗手→緩沖間→風淋室→各操作室。食品/飲料無菌潔凈車間物流由外走廊經過機械連鎖自消毒傳遞窗消毒后進入緩沖走廊后再經過傳遞窗進入各操作室。
2.凈化工程結構。根據《潔凈廠房設計規范》車間的墻體和吊頂必須采用不產塵、不積塵表面平滑的材料施工，并且不能在車間中存在死角。
3.凈化工程.照明系統。潔凈區應采用吸頂式凈化燈具，非潔凈區采用普通熒光燈。設計各房間內照明，紫外燈獨立控制，并均由電氣控制箱控制，再由總配電柜集中控制;室內照明均采用密閉照明燈組;插座盤均采用嵌入式;室內無明線敷設。
4.凈化工程地面。地面采用溶劑型環氧樹脂，表面密實，無起沙、空鼓、裂縫。顏色艷麗，防靜電性能恒久不變，可承受中等以下載荷，耐高溫。
5.凈化工程通風空氣凈化設備。潔凈廠房設計，按照規范要求，設計送回風系統。
