目前經常使用的殺菌消毒方法有紫外線、臭氧及NICOLER消毒技術。它們都可以用于空間環境的殺菌消毒，但單一使用或使用其中任意兩個，都無法保證蛋糕加工環境良好的潔凈度，只有把三者有機合理利用，才能保證加工環境的潔凈，這就組合式空氣消毒法。其中的原理必須從各種消毒方式的殺菌特性來分述。
臭氧的化學式是O3,比空氣重。臭氧是一種廣譜殺菌劑。臭氧滅菌屬溶菌級，殺菌徹底，無殘留，可殺滅細菌繁殖體和芽孢、病毒、真菌等，并可破壞肉毒桿菌毒素，不僅對各種細菌有極強的殺滅作用，對殺死霉菌也很有效.影響臭氧殺菌的因素有PH值、濕度、溫度、有機物含量等，水中的PH值較高時，臭氧殺菌的濃度要相應提高；環境濕度低時，臭氧在空氣中的殺菌效果會很差；水溫度較高時，殺菌效果會不穩定；水中有機物較多時，也會降低臭氧的殺菌效果。臭氧殺菌并不是聞到臭氧的異味就表明在殺菌，需要科學的手段去有效檢驗，同時臭氧對人體有傷害，不能在有人情況下使用。
紫外線消毒燈在放電時會產生紫外線和微量臭氧，紫外線和臭氧并用的相乘作用在空氣凈化處理中發揮強大威力，細菌吸收紫外線后，引起DNA鏈斷裂，造成核酸和蛋白的交聯破裂，殺滅核酸的生物活性，致細菌死亡，殺菌效率可達99％－99.9％。但紫外線消毒燈照射殺菌受照射的距離限制，同時又有陰影效應。其安裝方式及高度決定了其不能為物體表面殺菌且不能在有人情況下使用。 NICOLER動態消毒技術是近年來才被廣泛使用的消毒技術，主要用于食品企業的包裝、冷卻及灌裝環節，國內首個真正意義上的食品企業專用的動態消毒設備。
“NICOLER消毒機”的原理為：通過特殊的脈沖信號使得NICOLER發生腔產生逆電效應，生成大量的殺菌因子，整個殺菌過程只需0.1秒，使生產車間的環境保持在相對的“無菌無塵”狀態。在對車間消毒時，人可同時在車間內工作，對人體沒有任何危害，所以，該種NICOLER消毒技術也稱作“NICOLER動態消毒機”。 應用實例：一般的蛋糕焙烤車間的高度在3-3.5米，如單用臭氧殺菌，由于蛋糕是高蛋白產品，分子蛋白能保護部分細菌不被臭氧殺滅，而且臭氧比空氣重，在距地面2米以上空間的浮游菌較難殺滅，當浮游菌一旦沉降，就產生污染產品的可能，如采用風道強制循環，產生空氣亂流，會有空間遺漏，如循環管道過長，臭氧在循環過程中就分解成氧氣，同樣會有空間遺漏；如單用紫外線消毒燈，則距消毒燈1.5米外的細菌較難殺滅，即使放低照射高度，也因為存在陰影效應，加工臺下方滅菌的可操作性不強；如單使用NICOLER動態消毒機滅菌，雖然可在有人工作（動態）情況下持續殺滅空氣中細菌，防止生產過程中空氣中微生物二次污染食品，但該設備的采購價格比較貴，如果24小時持續運行必然降低其使用壽命，只適合工人在上班時開機殺菌消毒使用。
綜上所述，各種消毒方法在加工車間的消毒中都有優缺點，而把三種方法結合起來，恰好能取長補短。 現以江蘇常州某食品有限公司蛋糕內包車間實際操作為例來講述三種消毒方法的綜合應用。生產車間每天工人下班后用紫外線消毒燈和臭氧同時消毒，用以殺滅環境中及物體表面細菌；白天工人上班后，使用NICOLER動態消毒技術持續殺滅環境中微污染源，如此的操作可以高效的殺滅空氣中的浮游菌及沉降菌，使生產車間保持非常高的潔凈度。經長期的檢測及對比證明，組合式空氣消毒法能同時有效殺滅空間環境中的浮游菌及沉降菌，防止因空間消毒不徹底而引起的二次污染。現實中很多具備HACCP認證的焙烤加工企業，明明嚴格按照HACCP流程操作，但在最終產品檢測上，細菌總數及霉菌卻往往超標，同時相同工藝而多批次產品細菌總數相差甚遠，細究原因，往往是忽視了空間殺菌不徹底而導致的二次污染的因素。 綜上所述，組合式空氣消毒法在保持蛋糕加工環境的潔凈度上有著非常積極的意義。在食品加工中根據工藝條件，合理應用組合式空氣消毒法，可以最大限度防止生物危害的發生。