層流傳遞窗主要用于潔凈區和潔凈區之間或潔凈區和非潔凈區之間的物品的傳遞(主要應用于生物制藥行業)，其原理是通過層流自凈的方式把打開門后在放置產品過程中帶入傳遞窗的灰塵。層流傳遞窗的風速一般在0.3-0.8米/秒，通過層流過濾的形式，使傳遞窗內部形成一個百級的凈化環境，從而使在潔凈區內打開門后不會形成污染。
風淋式傳遞窗主要用于潔凈區和潔凈區之間或潔凈區和非潔凈區之間的小件物品的傳遞，通過吹淋方式利用通過凈化后的空氣高速把產品上表面的灰塵吹掉，從而避免把產品表面的灰塵帶入潔凈區。在層流自凈的過程中，往往會通過時間繼電器控制傳遞窗的門鎖，如果沒有到達自凈的時候，傳遞窗的門是打不開的;風淋傳遞窗的內部因為其結構和風速決定了其凈化程度只能達到千級的凈化效果，而層流傳遞窗的一個基本要求，較少也要達到千級，較高可達到十級甚至一級的效果。
在制藥行業新版GMP對傳遞窗的管理要求中，因為許多生產車間都是百級甚至十級的區域，為了避免傳遞物對潔凈室的影響，新版GMP對傳遞窗的要求比以往提高了許多，所以以往的風淋傳遞窗的作用就不符合要求，必須要用層流傳遞窗以避免污染其生產環境，新版GMP傳遞窗在于嚴格按照自凈時間，沒有達到自凈時間無法取出物品，從而達到GMP管理要求。所以，選用此兩款傳遞窗較重要的個問題就是取決于到底是用在什么地方!