手術室凈化一個非常重要的原則是要求做到了潔污分明，減少交叉污染，達到全過程控制和全面控制的原則。要做到分區合理，流向簡明，潔凈區相對集中，路線短捷，各種相應的功能房盡可能齊備，使用和管理方便。手術室凈化必須分為潔凈區與非潔凈區。潔凈區與非潔凈區之間必須設置緩沖室(段)或傳遞窗。
幾種不同布局的手術室凈化模式
由于各醫院的建筑平面不同，選用的手術室凈化平面布局也可不同，可根據本醫院的實際情況和使用習慣來決定。現介紹幾種常見的手術室凈化平面布局模式：
l、中心島供應方式
本方式適宜于占地面積比較大，手術部面平層比較寬大，周圍為手術室及部分輔助用房。中心區為無菌物品供給及主要輔助用房。無菌物品供給及主要輔房對手術室而言呈放射狀，相對集中、便捷，潔污分明、沒有交叉。
2、單通道式
可在手術室后不設污物通道，手術室不開后門。手術后的污物和器械可分類打包，裝入密閉桶內運出手術室，不給潔凈走廊帶來污染。在手術部設一消毒沖洗間做處理后由污梯運出。不存在交叉污染的情況，能節約使用空間和運營費用。
3、獨立單元式
每間手術室都有獨立的前輔室，即麻醉準備間、刷牙間(可兩間手術室合用一間)，沖洗消毒間等。對手術室凈化而言，是做到了病員通道與醫生通道分開，潔物通道與污物通道分流。這種方式占用的開間比較大，在我國只有極少數醫院采用。
4、單面供應式
手術室凈化多設計在樓層的一面，而對面為無菌物品供給及輔助用房。該形式多為舊樓改造中原樓面比較窄的情況。有的為單通道，有的為雙通道。
5、外廊回收式(多通道式)
此形式在我國已改造的手術室凈化中最為多見，手術部分為潔凈走廊和清潔走廊(污物通道)，醫務人員、病員和無菌物品在潔凈走廊內運行。手術后的污物由護工收集經過污物走廊送至污洗間處理。此形式多在手術室開通向污物通道的門，易造成交叉污染。如選用此形式，最好將污物通道門改為傳遞窗，或在高級別手術室通污物通道處設緩沖段。