隨著社會經濟的快速發展，人們對生活、工作和產品生產過程、產品質量等都提出了更高的要求。康德萊凈化表示，如何合理使用手術室凈化，防止差錯、污染和交叉污染的發生，是GMP的核心內容之一。眾所周知，人體本身就是手術室的主要污染源。那么我們如何防止或控制手術室凈化中被污染呢？
人是決定手術室中微粒污染物產生的重要因素。手術室凈化過程中的每個成員都應充分了解個人衛生習慣對手術室凈化清潔的影響，并遵循正確的行為，以有效防止手術室凈化環境中人為顆粒污染物的產生。
交叉污染是指由于人員，運輸，物料傳輸，氣流，設備清洗，消毒，后清洗等各種藥物的混合，或由于人員，設備，材料，空氣的不適當流動而造成的污染。將低清潔度地區的污染物引入清潔程度高的地區。那么，如何防止交叉污染呢？2002年實施的“清潔廠房設計規范”明確指出，清潔廠房的工藝平面布置應合理、緊湊。手術室凈化或潔凈區只設置必要的工藝設備和空氣清潔度要求。
合理的布局必須首先簡化過程并避免往返。工作室的平面空間應合理，有利于操作，易于維護，未使用的區域和空間不應保留。合理的空間和面積也有利于合理分區，防止混合事故。應該注意的是，手術室凈化工程并不是越大越好。面積和空間大小與送風量有關，決定空調能耗，影響項目投資。但手術室凈化工程的空間面積不能太小，太小可能不易操作和維護。
因此，合理的空間區域設計應考慮設備運行和維護的需求。生產區域和存儲區域應具有適合生產規模的空間，以容納易于操作和維護的設備和材料。一般來說，手術室凈化工程的高度控制在2.60米。對于一些較高的設備，潔凈區的高度可以局部提高，但不適合全面提高潔凈區的高度。車間應有一個物料中間站，足夠大，可以存放物料、中間產品、待檢產品和成品。也便于明確分區，以減少誤差和交叉污染。
另外，手術室凈化中密封程度和管理系統與交叉污染有關。因此，康德萊凈化提醒，除了合理布局外，還必須提高手術室凈化設備的自動化水平以形成鏈接的生產線，以減少操作人員的活動頻率，防止交叉污染。