無菌實驗室也叫無菌試驗室，主要用于生物化學、生物醫學、微生物學、動物實驗、基因重組以及生物制品等研究使用的實驗室，統稱潔凈實驗室。
根據多年的行業為經驗認為，無菌實驗室設計和建設需要重點關注以下內容：
一、無菌實驗室規劃方案及平面布局
1、組成：無菌實驗室由準備室、洗滌室、滅菌室、無菌室、恒溫培養室和普通實驗室六部分組成。這些房間的共同特點是要求地板和墻壁的質地光滑堅硬，儀器和設備的陳設簡潔，便于打掃衛生。
2、內外間要求：無菌實驗室應有內、外兩間，內間是無菌室，外間是緩沖室。所有的房間面積不宜過大，吊頂不宜過高，要便于空氣滅菌。
3、安全要求：無菌試驗室、生物安全實驗室必須保證人身安全、環境安全、廢棄物安全和樣本安全，能長期而安全地運行，同時還需要為實驗室工作人員提供一個舒適而良好的工作環境。
二、無菌實驗室基本要求和配置條件
（一）準備室——準備室用于配制培養基和樣品處理等
室內設有試劑柜、存放器具或材料的專柜、電源、電爐、冰箱、實驗臺和上下水道等。
（二）洗滌室——洗滌室用于洗刷器皿等
由于使用過的器皿已被微生物污染，有時還會存在病原微生物。因此，在條件允許的情況下，最好設置洗滌室。室內應備有加熱器、蒸鍋，洗刷器皿用的盆、桶等，還應有各種瓶刷、肥皂、洗衣粉、去污粉等。
（三）滅菌室——滅菌室主要用于培養基的滅菌和各種器具的滅菌
室內應備有烘箱、高壓蒸汽滅菌器等滅菌設備及設施。
（四）無菌室——是系統接種、純化菌種等無菌操作的專用實驗室
無菌室也稱接種室，在微生物工作中，菌種的接種移植是一項主要操作，這項操作的特點就是要保證菌種純種，防止雜菌的污染。在一般環境的空氣中，由于存在許多塵埃和雜菌，很易造成污染，對接種工作干擾很大。